לאחר שהמו"מ של משגב עם האוצר, עם רשות המיסים ועם היועצים משפטיים לא הביא לתוצאה המקווה של הכללת משגב במפת הטבות המס, הגישה משגב עתירה לבג"ץ כנגד רשות המיסים, בדרישה שתכיר בתושבי משגב כמדורגים באשכול חברתי כלכלי 6, אשכול המזכה את תושבי משגב בהטבות המס המתאימות.
הזכאות להטבות מס נקבעת על פי צבירת ניקוד ב-3 קטגוריות: מגורים בסמוך לגבול, דירוג באשכול המדד הפריפריאלי, ודירוג באשכול החברתי-כלכלי. משגב נכללת במפת ההטבות על פי שני הקריטריונים הראשונים, ועל פי פסיקת בג"ץ יש לנהוג בה כזכאית להטבות גם על פי הקריטריון השלישי.המחלוקת של משגב עם רשות המיסים היא על הקריטריון השלישי, האשכול החברתי-כלכלי של תושבי משגב, כאשר המועצה דורשת לראות אותה כמדורגת באשכול 6, המזכה בהטבות מס, ורשות המיסים נוהגת במשגב כמדורגת באשכול 7, שאינו מזכה בהטבות.
רון שני, ראש המועצה, מבהיר: "דרישתנו מבוססת על פסיקת בג"ץ בעתירה שהגשנו וזכינו בה. רוב משרדי הממשלה נוהגים על פי הפסיקה ומזכים אותנו בתקציבים של אשכול 6, אך רשות המיסים נוהגת בנו כמדורגים באשכול 7. אני מקווה ומשוכנע שבית המשפט העליון ייעתר לדרישתנ./"
הבג"ץ שהוגש מתייחס לשנת המס 2016 ופסיקה לטובת משגב תזכה את התושבים על הטבות המס של שנה זו. לקראת סוף השנה תפרסם הלשכה המרכזית לסטטיסטיקה מדד חברתי-כלכלי מעודכן, וזכאות משגב להטבות מס משנת 2017 ואילך תיקבע על פי הדרוג החדש.
